Da organização e forma de disputa
O Campeonato será disputado em 02 (duas) Fases, sendo a primeira em turno e returno com as 04 (quatro) Associações participantes, com jogos de ida e volta, num total de 06 (seis) rodadas. Ao final de cada turno será declarado um campeão, que conquistará o direito de jogar a grande final em um único jogo, com a vantagem do empate no tempo normal para a equipe de melhor índice técnico nos dois turnos e o direito do mando de campo. Caso uma equipe seja vencedora dos dois turnos será automaticamente declarada Campeão do 1º Campeonato Brasiliense da 3ª Divisão de 2006 que ascenderá a 2ª Divisão de 2007.